永康市档案馆是县（市）级国家综合性档案馆，其前身是中共永康县委、县府（县人委）的机关档案室。1960年1月正式成立永康县档案馆，由县委办公室主任直接领导，配专职档案干部２名。“文革”期间被迫停止工作，1981年4月恢复档案馆工作。1983年4月建立县档案科，馆科两块牌子，一套班子，合署办公，为县委、县人民政府的直属机构，归口县委办公室管理，配工作人员3名。1986年7月撤销档案科，建立档案局，列入县政府序列，为县政府组成局之一，局、馆两块牌子，合署办公，档案馆定编6人，档案局定编人。1991年３月建立档案局党组，局、馆人员增至11人。1992年10月，永康撤县设市，永康县档案局、档案馆随之改称永康市档案局、档案馆。1996年市机关机构改革中，市档案局与市档案馆于11月合并为永康市档案馆（局），保留档案局牌子，为市委办公室管理的正科级事业单位，设置办公室、业务指导监督科2个职能科室，定编10名。1996年12月，市志办公室与市档案馆合署办公，增挂市志办牌子。2002年４月，称永康市档案局（档案馆），实行一个机构，两块牌子，履行全市档案事业行政管理和档案保管、利用职能，内设3个职能科室：办公室、业务监督指导科、档案保管利用科，定编9名。市志办由档案局管理。2009年11月，内设科室“业务监督指导科”增挂“行政审批科”牌子，2011年11月，内设科室“档案保管利用科”增挂“电子文件和数字档案登记备份中心”牌子，增加2名编制。2019年1月11日，市档案局划入市委办公室，市志办划入市党史研究室，市档案馆作为市委直属的正科级参公事业单位，核编9名，内设办公室、接收指导科、保管利用科3个科室，负责全市档案接收、征集、保管、利用服务的职能。

永康市档案馆2014年11月晋升为国家三级档案馆。2020年5月，通过省级规范档案馆评价。曾先后获得全省档案系统先进集体、金华市档案工作先进单位、省依法治档示范区创建单位等荣誉。截至2020年底，永康市档案馆馆藏档案全宗222个（建国前12个，建国后210个），纸质档案22.7余万卷，29.88余万件，图书资料1.49余万册，涉及全市政治、经济、文化、教育等方面内容。